TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?
ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 適配illumina平臺(tái)
| 目錄號(hào) | 規(guī)格 | 單價(jià) |
|---|---|---|
| KP171-01 | 12 rxns | 3960 |
| KP171-02 | 96 rxns | 28160 |
產(chǎn)品詳情介紹
TransNGS? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina?是針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)開(kāi)發(fā)的，適用于普通哺乳動(dòng)物細(xì)胞的ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒，所得文庫(kù)可用于單端或雙端測(cè)序。該試劑盒采用新型的轉(zhuǎn)座酶技術(shù)，針對(duì)染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域建庫(kù)測(cè)序，僅需3個(gè)小時(shí)即可完成實(shí)驗(yàn)。所需細(xì)胞量少，10-50000細(xì)胞的起始量均可以獲得高分辨率的測(cè)序圖譜。
文庫(kù)產(chǎn)量高
對(duì)3種哺乳動(dòng)物細(xì)胞以50,000、10,000 cells為起始細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明， TransGen產(chǎn)品針對(duì)不同細(xì)胞及投入量，均可構(gòu)建高產(chǎn)量文庫(kù)。
細(xì)胞起始量低
對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-1,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建，不同細(xì)胞投入量的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)如上表。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品可用于構(gòu)建低起始量（50個(gè)細(xì)胞）的ATAC文庫(kù)，文庫(kù)產(chǎn)量高，峰型好。
與競(jìng)品比較
分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對(duì)不同細(xì)胞投入量（5,000-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品的文庫(kù)產(chǎn)量、文庫(kù)峰型與競(jìng)品相比，優(yōu)于競(jìng)品。
下機(jī)數(shù)據(jù)好
對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建，將構(gòu)建后的文庫(kù)測(cè)序，下機(jī)后進(jìn)行生信分析。結(jié)果表明，TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周?chē)患黠@，IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點(diǎn)與H3K4me3基因的ChIP-seq結(jié)果一致，實(shí)驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。
1.Bao X, Gao Y, Chen X, et al. A one-base therapeutic insertion in the HBG2 distal promoter reactivates γ-globin expression[J]. Experimental Hematology & Oncology, 2025. (IF 13.50)
